我院疼痛科由麻醉科发展而来，1990年正式开设疼痛门诊，2001年开设疼痛病房，2003年成为全国“胶原酶微创介入治疗培训基地”，2005年床位11张，2010年经安徽省卫生厅批准正式成立“疼痛科”。床位扩展为30张，位于外科病房二号楼一楼东侧，2014年收治各种疼痛病人1500人次，门诊接诊病人12000余人次，完成微创介入手术1000余台次，2012年成为“中华医学会疼痛学分会临床培训医院”。疼痛科现有医师11人，护士12人，其中主任医师、教授2人，副主任医师、副教授3人，主治医师3人，住院医师3人，博士3人，在读博士1人，硕士5人，疼痛科长江路门诊位于6楼、9楼，绩溪路门诊位于4楼B区，周一至周五全天开诊。

疼痛科主要治疗各种慢性疼痛性和非疼痛性疾病，如头痛、颈椎病、颈椎间盘突出症、肩周炎、颈肩综合症、胸背痛、腰肌劳损、腰腿痛、腰椎间盘突出症、骨质疏松及压缩性骨折、坐骨神经痛、骨关节炎、肌腱炎、顽固性失眠、顽固性呃逆、痛经、面瘫、三叉神经痛、带状疱疹后神经痛、肋间神经痛、癌症疼痛等。经过20余年的发展，疼痛科已逐步形成以各种神经阻滞/毁损、微创介入等特色疗法，如CT引导靶位注射胶原酶髓核溶解术、CT引导臭氧髓核消融术，CT引导低温等离子髓核消融术、CT引导注射骨水泥经皮椎体成形术（PVP/PKP）、CT引导半月神经节射频消融术、CT引导背根神经节脉冲射频术、CT引导骶管囊肿抽吸加生物蛋白胶封堵术、CT引导奇神经节/交感节/神经丛毁损术、鞘内泵植入术、孔镜等一批核心技术。